Peruanska vlada je ustanovila posebno komisijo za zaščito arheološkega najdišča Machu Picchu, sicer bi se utegnilo pripetiti, da bi ga Unesco umaknil s spiska ogrožene svetovne kulturne dediščine, kar bi predstavljalo "težko moralno sankcijo proti Peruju".
Unesco je večkrat izrazil skrb zaradi kaotične urbanizacije v neposredni bližini Machu Picchuja. Nova komisija pa bo odslej skrbela, da se zagotovi ustrezen način ohranjanja tega arheološkega spomenika, da se bo ohranjala njegova skladnost in naravne ter kulturne karakteristike.