S sprejetimi spremembami naj bi se preoblikovali pogoji za uveljavljanje davčnih ugodnosti za poslovanje v ekonomskih conah, in sicer tako, da bo zakon usklajen z nacionalnim pravnim redom glede državnih pomoči in sprejetimi mednarodnimi obveznostmi. Spremembe so potrebne zaradi uskladitve z zahtevami EU glede dodeljevanja državnih pomoči. Po zagotovilih predlagatelja vse obstoječe davčne olajšave za uporabnike ekonomskih con ostajajo nespremenjene, spreminjajo se le nameni, po katerih jih je mogoče uveljavljati.
V okviru odločanja o dopolnilih se je glede na nekatere predlagane rešitve, ki so po mnenju predstavnikov vlade nesprejemljive, razvila polemična razprava. Tako je denimo parlamentarna večina podprla amandma skupine poslancev s prvopodpisanim Jožetom Avšičem (LDS), po katerem se lahko "ekonomska cona ustanovi na območju, kjer je pristanišče, letališče, železniška postaja ali cestni prehod, ki je odprt za mednarodni blagovni promet". S tem so po prepričanju državnega sekretarja na finančnem ministrstvu Darka Končana na novo odprli skoraj zaključeno poglavje na področju konkurence in državne pomoči. Po sedaj veljavni zakonodaji pa lahko ekonomske cone delujejo le na mednarodnih letališčih in pristaniščih. Pomisleke ali nasprotovanje pa je Končan izrazil tudi v zvezi s poslanskimi amandmaji za prestavitev uveljavitve zakona za eno leto, na 1. 1. 2003.
