Nadzor ministrstva je namreč pokazal, da je bila večina sredstev sicer porabljena namensko, vendar fundacija dokazil o porabi omenjenih dveh milijonov tolarjev še ni predložila. Kot je zatrdil direktor AFR Karel Lipič, bodo ta dokazila predložili v določenem roku desetih dni, to je do 25. septembra, saj bo v nasprotnem primeru ministrstvo od fundacije zahtevalo povračilo.
Prav tako pa bo v določenem roku fundacija dopolnila poročilo o porabi proračunskih sredstev Mestne občine Ljubljana (MOL), ki jih slednja fundaciji namenja za financiranje njenih projektov, je povedal Lipič.
Ministrstvo za delo je strokovni in upravni nadzor na AFR izvajalo avgusta in septembra in ugotovilo več pomanjkljivosti pri izvajanju projektov Aids in Stigma. Tako se pogodba o sofinanciranju projekta Stigma ne izvaja v celoti, ugotovljene pa so bile tudi strokovne ter organizacijske pomanjkljivosti. Finančni nadzor porabe sredstev v letu 2002 in prvem polletju leta 2003 sicer še ni končan, dosedanje ugotovitve so pokazale, da je bila večina sredstev ministrstva porabljena namensko, manjkajo pa dokazila o porabi skoraj dveh milijonov tolarjev.