V Luki Koper opredeljujejo kakovostne storitve kot pogoj za dolgoročno uspešnost, zato je bil prvi korak pridobitev mednarodnega standarda ISO 9002 leta 1097. Nadaljnji cilji koprske družbe pa so bili usmerjeni k ustreznemu odnosu do okolja in obvladovanju vplivov dejavnosti, proizvodov in storitev na okolje ali zdravje in varnost ljudi.
S pridobitvijo standarda ISO 9001 je Luka Koper letos uspešno prestala razširjeno presojo sistema kakovosti. Medtem ko je bila pridobitev standarda za sistem ravnanja z okoljem usmerjena tudi v intenzivno prilagajanje okoljski zakonodaji, ki velja v Sloveniji in v EU. Za okoljske naložbe in znanje zaposlenih so v zadnjih treh poslovnih letih v Luki Koper namenili 1,36 milijarde tolarjev.
Z usklajevanjem poslovanja z evropskim modelom poslovne odličnosti želijo v Luki Koper doseči trajno in dolgoročno stabilnost podjetja. Njihov cilj je postati osrednje pristanišče za države srednje Evrope.