Za mesto generalnega direktorja največje slovenske bolnišnice se lahko potegujejo posamezniki, ki imajo univerzitetno izobrazbo z dodatno izobrazbo na področju upravljanja ter najmanj pet let delovnih izkušenj na področju organizacije, vodenja in upravljanja. Kandidat mora ob prijavi predložiti program dela in razvoja Kliničnega centra, obvladati pa mora vsaj en svetovni jezik.
Generalnega direktorja imenuje svet KC s soglasjem vlade, in sicer za dobo štirih let.
Generalni direktor KC Franc Hočevar je, kot je znano, 22. aprila odstopil iz osebnih razlogov, do konca maja pa bo opravljal funkcijo vršilca dolžnosti.