Posebej zaskrbljujoče, menijo na Liberalni akademiji, je poseganje vlade v različne organe na državo vezanih gospodarskih subjektov in v upravne in svetovalne organe javnih zavodov, pri čemer se vlada ne ozira na mandate imenovanih, uspešnost dela in strokovnost funkcij. Bajukova vlada se v mnogih primerih zavestno in hote giblje na robu ravnanj, ki so še sprejemljiva in razumljiva v pravni državi.
Kot menijo, slog takšnega delovanja kaže na težnjo po ideološki unifikaciji družbe in po oblastni monopolizaciji vseh pomembnih družbenih dejavnosti. Vlada bo s takšnimi samovoljnimi ukrepi in poglabljanjem ideološkega ločevanja v družbi skušala opredeliti tudi javne medije po vzoru oblasti. Nesmotrno ravnanje s kadri po mnenju članov liberalne akademije pomeni nezanemarljive stroške na račun davkoplačevalcev, to pa bo dolgoročno težko popravljivo.
Liberalna akademija poudarja, da je Bajukova vlada pri harmonizaciji zakonodaje z EU prišla v nasprotje z lastnimi obljubami, saj je namesto pospešitve procesa prilagajanja uniji ta proces zaustavila z zamenjavo številnih usposobljenih kadrov in izvedbo nepotrebne razmestitve v ministrstvih. Iz vladnih krogov pa so javnosti servirali nedvoumna sporočila o večletnem zamiku ciljnih datumov pridružitve k EU, še pravijo na Liberalni akademiji.