Zavod za sodobno umetnost (bivši Sorosov center za sodobne umetnosti) je v začetku leta 1999 zasnoval raziskovalni projekt Manifesta na domačem pragu. Projekt proučuje delovanje sodobnega umetnostnega sistema na primeru Manifeste 3. Raziskava je osredotočena na tri teme: analiziranje samopodobe Manifeste 3, proučitev vpliva Manifeste 3 na lokalno likovno sceno in analiziranje umetniških del, razstavljenih na Manifesti 3.