Ugotovitve računskega sodišča so šokantne, saj kažejo s prstom tudi na sedanjega ministra Pavleta Zgago, ki je bil leta 1996, ko je bila opravljena revizija državni sekretar za visoko šolstvo. Glavne ugotovitve:
- notranje kontrole na ministrstvu so bile pomanjkljive, zato obstaja tveganje, da je bil denar namenjen izvajalskim oranizacijam nepravilno in nezakonito dodeljen
- ministrstvo je nadure vodilnih izplačevalo v obliki plače, s tem so nezakonito izplačali več kot milijardo tolarjev;
Minister Zgaga to trditev zavrača, saj pravi, da so na tak način celo privarčevali nekaj proračunskega denarja. Leta 1996 se je namreč vpis na univerzo občutno povečal, zato so imeli profesorji več dela. Nadure pa so za državo dražje od rednega dela.
Računski sodniki ministrstvu očitajo še, da je bilo premoženje univerz prikazano nerealno, zaradi nedoslednega beleženja porabe denarja za investicije pa namenske porabe ni bilo moč kontrolirati.
Negativno mnenje računskea sodišča je dokončno, kar pomeni, da ga ni več moč izpodbijati. Kakšne bodo posledice, pa bo jasno že v kratkem, ko bo poročilo obravnaval parlamentarni odbor za nadzor proračuna. Slišati je že namigovanja, da je bil to eden izmed vzrokov za nedavni odstop Slavka Gabra.