Predlog sestave vodstva resornih delovnih skupin, ki bodo skrbele, da bo Slovenija v postopkih sprejemanja evropske zakonodaje pravočasno in ustrezno oblikovala svoja stališča, je na podlagi predlogov resornih ministrstev in vladnih služb pripravila služba vlade za evropske zadeve (SVEZ), ki v vladni strukturi ostaja osrednji koordinator za področje Evropske unije.
V postopkih zavzemanja stališč do sprotnih vprašanj znotraj EU bo SVEZ v sodelovanju z ostalimi ministrstvi določil pristojno ministrstvo, ki mora pripraviti predlog stališča, določil bo tudi pristojno delovno skupino, ki naj se z vprašanjem ukvarja.
Omenjenih 35 resornih delovnih skupin predstavlja institucionaliziranje pomožne koordinacijske strukture v okviru vlade. Sam sistem koordinacije vladnega dela za potrebe delovanja v okoliščinah članstva v EU bo uradno začel teči 16. junija, sicer pa ima za to, da delovanje gladko vzpostavi, Slovenija čas do 1. maja 2004, ko naj bi uradno postala članica EU.
Poleg omenjenih 35 resornih delovnih skupin bo oblikovana tudi delovna skupina za evropske zadeve pod vodstvom ministra za evropske zadeve Janeza Potočnika. Ta bo oblikovala prednostne naloge in cilje Slovenije v EU oziroma predloge zanje. Sestavljena bo iz strokovnjakov v in izven državne uprave.
Delovna skupina bo pripravljala predloge stališč do strateških dokumentov EU ter koordinirala pogajanja o finančnih perspektivah, temeljnih reformah in skupnih politikah unije. Delovna skupina za evropske zadeve bo tudi usklajevala stališča do tistih predlogov, do katerih na predhodnih ravneh koordinacije ne bo moč zavzeti.
Resorne delovne skupine, ki se vsebinsko orientirajo na posamezne politike Evropske unije, v glavnem vodijo državni sekretarji ali državni podsekretarji s pristojnih ministrstev.
