Poslanci SDS, NSi in SNS s prvopodpisanim Brankom Kelemino (SDS) menijo, da je pogodba škodljiva za Slovenijo, še posebej pa za lokalne skupnosti, zato je pred podpisom potrebno popraviti najbolj sporne in za slovensko državo škodljive pogodbene rešitve.
V opozicijskih parlamentarnih strankah se nikakor ne morejo strinjati z odločbo, da se bodo vse pristojnosti v zvezi s pravicami in obveznostmi gradnje in izkoriščanjem NEK prenesle na novega pravnega naslednika, to je družbo Eles Gen s sedežem v Ljubljani. "S tem se namreč določene poslovne funkcije iz Krškega selijo v Ljubljano, namesto obratno. Zato zahtevamo, da ima novi ravni naslednik sedež v Krškem, najbolje v bjektih NEK, kar je tudi najbolj racionalno in funkcionalno," so zapisali.
Poleg tega po njihovem prepričanju slovenska država že v izhodišču ne bi smela nikakor privoliti v lastniško razmerje med Slovenijo in Hrvaško 50:50 in iz tega izhajajoče pravice in obveznosti. Objekti NEK stojijo namreč na slovenskem ozemlju. "Hrvaška je lahko 50-odstotna lastnica energetskih objektov, ne more pa biti lastnica jedrskega objekta, ker pravice in obveznosti iz mednarodnih sporazumov in pogodb niso prenosljive in zavezujejo samo Slovenijo," so poudarili.
Ne pristajajo tudi na rešitev, da je začasno skladiščenje radioaktivnih odpadkov in rabljenega jedrskega goriva do konca življenjske dobe lahko na lokaciji NEK. "Odvoz radioaktivnih odpadkov
in izrabljenega goriva se mora začeti prej, najkasneje z letom 2010".
Zahtevajo še, da se prenos električne energije prek slovenskega ozemlja uredi na novo s to pogodbo, "ne pa na podlagi neke obstoječe prakse, po kateri so se vršili prenosi elektrike praktično brezplačno". Po prepričanju podpisnikov se mora v proizvodno ceno električne energije iz NEK, poleg obstoječih javnih dajatev med obratovanjem, vključiti tudi nadomestilo za odškodnino v času razgradnje.
