S pravilnikom se med drugim določajo kriteriji za opredelitev te skupine otrok ter sestava, delo in plačilo zdravniških komisij, ki dajejo mnenja v postopkih za uveljavljanje pravic zanje. Pravilnik tudi predpisuje obrazce mnenj, ki so sestavni del tega pravilnika.
Minister, pristojen za varstvo družine, na predlog Pediatrične klinike v Ljubljani imenuje pet zdravniških komisij prve stopnje in zdravniško komisijo druge stopnje, ki dajejo mnenja centrom za socialno delo oziroma ministrstvu v postopkih za uveljavljanje pravic za otroke, ki potrebujejo posebno nego in varstvo.
Komisijo sestavljajo trije člani zdravniki, od katerih je eden predsednik komisije, in en strokovni sodelavec. Imenovana je za štiri leta. Zaprosilo za izdelavo posameznega mnenja pristojni center za socialno delo v postopku na prvi stopnji oziroma ministrstvo v pritožbenem postopku posreduje pristojni zdravniški komisiji, ta pa na podlagi posredovane zdravstvene in druge dokumentacije poda mnenje na obrazcih, predpisanih s tem pravilnikom. Izjemoma lahko opravi pregled otroka. Mnenja izdaja v postopkih uveljavljanja posameznih pravic, ki so daljši dopust za nego in varstvo otroka, dodatek za nego otroka, krajši delovni čas zaradi starševstva in delno plačilo za izgubljeni dohodek. Zdravniška komisija pošlje mnenje skupaj z dokumentacijo organu, ki je za mnenje zaprosil, v 30 dneh od prejema zaprosila.
Članom zdravniških komisij pripada za delo plačilo po točkovnem sistemu. Vrednost točke znaša 2,2 odstotka izhodiščne plače za negospodarstvo.
