Stroški avtocestnega programa so trenutno ocenjeni na 4 milijarde 590 milijonov ameriških dolarjev. Da bo pri tem ostalo, pa ni nobenih zagotovil. Najbolj škandalozen primer tega je gradnja ljubljanskega dvocevnega predora čez Golovec s po tremi pasovi, ki je na koncu stal skoraj enkrat več kot je bila cena na razpisu.
Po zamenjavi predsednika uprave Darsa Brodnika je vlada sprejela določene ukrepe. Od možnega zadolževanja v tujini so doslej izkoristili že več kot tri četrtine, vlada pa je doslej najela za milijardo 400 milijonov ameriških dolarjev posojil, zadolžili pa naj bi se še za dodatnih 300 milijonov dolarjev. Skupen znesek tujih posojil bi bil tako najmanj milijardo 700 milijonov dolarjev.
Glede na verjetnost nadaljnjega zadolževanja v tujini, bo morala država dosedanje načrte najkasneje v dveh letih uskladiti z bencinskim davkom, ki ga plačujemo za gradnjo avtocest. Kar pomeni, da bo treba ponovno podaljšati roke za dokončanje avtocestnega programa, najverjetneje v leto 2008 in še čez. Pri tem bo treba odločiti tudi, kateri odseki se bodo gradili prej.