Andrej Lovšin je že ob izbruhu afere trdil, da so vojaški obveščevalci z nadziranjem njega in veleposlanika Mirošiča delali protizakonito. Že sami zaupni dokumenti so zgovorni: v poročilu o službeni poti v Sarajevo tako tajni agenti direktorju službe Marjanu Miklavčiču na primer poročajo, ''da ima Andrej Lovšin zelo dobre odnose z ambasadorjem Mirošičem in da je v zelo dobrih odnosih tudi z neko delavko ambasade, ki naj bi bila Mirošičeva ljubica.'' Gre za početje, ki je po mnenju Lovšina in parlamentarne komisije za nadzor nezakonito, in ker je Lovšin z izbruhom afere utrpel tudi poslovno škodo, je proti odgovornim napovedal kazensko ovadbo.
Obrambno ministrstvo zadnjih dogodkov v zvezi z afero še ne komentira, vlada pa je svojčas že presodila, da so obveščevalci v Sarajevu delovali zakonito. Zanimivo je, da je vlada takšno mnenje oblikovala na podlagi poročila komisije, ki jo je sedanji direktor policije Andrej Podvršič. Če se bo njegovo poročilo o sarajevski aferi zdaj izkazalo za napačno, bo Podvršič gotovo izgubil velik del svojega ugleda.
Zadnjo besedo o sarajevski vohunski aferi bo torej moralo povedati pravosodje. Glede na dosedanje izkušnje pa lahko z gotovostjo napovemo, da se to ne bo zgodilo kmalu.