Glavni tajnik ljudske stranke Andraž Vehovar pa je dejal, da je pogodba sporna v več točkah. Besedilo je bilo namreč pripravljeno brez sodelovanja predstavnikov stroke, NEK in lokalnega prebivalstva, Slovenija pa se je v predpristopnih pogajanjiih z EU zavezala, da bo skladiščeneje radioaktivnih odpadkov uredila do leta 2007, medtem ko pogodba govori o začasnem skladiščenju v NEK do leta 2023.
Premier Janez Drnovšek in njegov hrvaški kolega Ivica Račan sta se na Reki dogovorila, da bosta probleme med državama reševala v paketu, zato po Vehovarjevih besedah zaradi zastoja pri dogovoru o meji ni razloga za hitenje pri sporazumevanju o NEK.