Bistvo spora je v tem, da je ministrstvo za kulturo mnenja, da je Betnavski dvorec izjemen kulturni spomenik, ki ga cerkvi ni mogoče vrniti. Stališče ministrstva temelji na strokovni oceni Urada za kulturno dediščino. Poseben problem pa je dejstvo, da je dvorec leta 1986 kupilo podjetje Lipa Ajdovščina, ki je dvorec temeljito obnovilo. Med drugim naj bi se cerkev s podpisom protokola z občino Maribor vrnitvi dvorca v naravi odpovedala že leta 1986.
Ko smo o omenjenem dokumentu vprašali na mariborski občini, so bili sprva presenečeni. Sinoči pa smo dokument, ki sta ga podpisala mariborski škof Franc Kramberger in tedanji predsednik občinskega izvršnega sveta Vinko Lapuh, le dobili. V njem jasno piše, da naj bi bile z uresničitvijo določil protokola dokončno rešene vse premoženjsko pravne zadeve, ki izhajajo iz naslova odškodnin za nacionalizirane cerkvene objekte in zemljišča na območju Maribora.