Slovenija lahko za agencijo pridobi ogromno, saj bo vezni člen med evropskim in slovenskim kmetijskim proračunom. Preko nje naj bi, ko bo agencija delovala s polno paro, v Slovenijo dobili med 30 in 90 milijardami tolarjev evropskega denarja, namenjenega kmetijstvu.
Ko bo agencija dosegla poln obseg, to naj bi bilo po besedah ministra Smrkolja leta 2003, pa bo državni proračun bremenila za kar 500 milijonov tolarjev letno.
