Potem ko se je izvedelo, da nemški obrambni minister Rudolf Scharping zagotovo ne bo nasledil Solane, je Blair za generalnega sekretarja zveze NATO predlagal Robertsona.
Robertson je po zmagi laburistov na volitvah maja leta 1997 postal obrambni minister v Blairovi vladi. V času kosovske krize se je zavzemal za trdo politiko do jugoslovanskega predsednika Slobodana Miloševića, obenem pa ni izključeval napotitve kopenskih enot na Kosovo.
Robertson je kot eden prvih zahodnih politikov javno označil Miloševića za vojnega zločinca in zahteval, da ga obtoži haaško sodišče za vojne zločine.
Blair je že prejel pozitivne odzive številnih voditeljev, ki se udeležujejo konference o paktu stabilnosti za JV Evropo v Sarajevu. Kandidaturo Robertsona so med drugim pozdravili ameriški predsednik Bill Clinton, francoski predsednik Jacques Chirac ter premiera Italije in Španije, Massimo D'Alema in Jose Maria Aznar.