Izetbegović je leta 1990 postal prvi predsednik večetničnega predsedstva BiH, v katerem je ostal 10 let. Med vojno v BiH (1992-1995) je bil vodja bosanskih muslimanov. Leta 1996 je doživel srčni infarkt, nato pa je zaradi težav s srcem precej časa preživel v bolnišnici, nazadnje sredi decembra. Zaradi slabega zdravja je lani odstopil s položaja, še vedno pa je častni predsednik Stranke demokratske akcije.
