Zgodovinskega referenduma so se volilci kljub bojaznim organizatorja, Združenih narodov, da zaradi nasilja in groženj prestrašeni ljudje ne bodo glasovali, udeležili presenetljivo visoko. Na volišča naj bi po nekaterih podatkih prišlo kar 90 odstotkov od slabih pol milijona upravičencev, lojalnih Indoneziji oziroma pristašev samostojnosti.
Prebivalci otoka so z izbiranjem med polno neodvisnostjo ali avtonomijo znotraj Indonezije prvič sami odločali o svoji prihodnosti. K mirnemu glasovanju so s spravljivimi izjavami precej prispevali tudi predstavniki vseh vpletenih v timorski konflikt.
