Bašir naj bi bil odgovoren za teroristične napade na Baliju leta 2002 in za lanski napad na hotel Marriott v Džakarti. Bašir je na sojenju zatrdil, da je nedolžen in da mu sodijo, ker ni v soglasju z interesi ameriškega predsednika Georgea Busha. "Vsi, ki niso v skladu z interesi Busha, so teroristi," je dejal na sojenju, ki ga spremljajo okrepljeni varnostni ukrepi. V in okoli poslopja, kjer poteka sojenje, je nameščenih 650 policistov in ostrostrelcev. To je sicer za Baširja že drugo sojenje zaradi terorizma v dveh letih.
Tožilci so prvi dan sojenja danes prebrali 65 strani obtožnice, v kateri ga obtožujejo, da vodi z mednarodno teroristično mrežo al Kaida povezano Džamajo Islamijo, ki je odgovorna za več napadov v Jugovzhodni Aziji, med drugim tudi za teroristični napad na Baliju, v katerih sta oktobra 2002 umrla 202 človeka, in napad na hotel Marriott v Džakarti, v katerem je avgusta lani umrlo 12 ljudi.
Bašir je po protiterorističnem zakonu obtožen tudi načrtovanja napada na hotel Marriott in vzpodbujanja svojih privržencev k izvedbi tega napada. Za to mu v primeru krivde grozi smrtna kazen.
