Kot je povedal nek predstavnik bahreinske vojske, naj bi emir nenadoma umrl po srečanju z ameriškim obrambnim ministrom Williamom Cohenom.
Državni radio in televizija sta prekinila redni program in objavila vest o emirjevi smrti.
Šejk Issa se je rodil leta 1934, prestol pa je zasedel leta 1961 po smrti svojega očeta. Do leta 1968 je imel emir lokalno oblast, saj je bil Bahrein tedaj po zgledu ostalih zalivskih monarhij britanski protektorat. Potem ko je zasedel prestol, je šejk Issa začel voditi bolj odprto politiko do Zahoda, še posebej do Združenih držav Amerike in Velike Britanije. Pristal je na namestitev ameriških in britanskih enot na ozemlju Bahreina, kjer ima sedež 5. ameriška flota.
Preminulega emirja naj bi na čelu države nasledil sin šejk Hamad ben Issa Al-Kalifa.
Ameriški obrambni minister Cohen je zaradi emirjeve smrti odpovedal novinarsko konferenco, prav tako pa je tudi preložil odhod v Saudovo Arabijo, kjer naj bi nadaljeval turnejo po državah Perzijskega zaliva in Bližnjega vzhoda.