Eksplozija je odjeknila okoli 9. ure po lokalnem času na tržnici v krščanskem predelu mesta, ko je bilo na njej veliko število ljudi. Po navedbah indonezijske tiskovne agencije Antara je bila večina žrtev študentov, eksplozija pa je povzročila škodo tudi na številnih prodajalnah in avtobusih. Odgovornosti za napad sicer ni prevzel še nihče.
Ambon je prestolnica otočja Moluki, ki leži okoli 2600 kilometrov vzhodno od Džakarte. Na otočju Moluki že od leta 1999 prihaja do verskega nasilja med kristjani in muslimani, v katerem je bilo doslej ubitih že 9000 ljudi. Zaradi nasilja je z otočja, ki sicer šteje približno 2,1 milijona prebivalcev, pobegnilo pol milijona ljudi. Sprti strani sta sicer februarja s posredovanjem vlade v Džakarti podpisali mirovni sporazum, kljub temu pa še vedno prihaja do posamičnih spopadov.