Ko je 52-letni politik stopil iz službenega vozila, ga je morilec napadel iz zasede. Vanj je izstrelil več strelov, nato pa odvrgel morilsko orožje in pobegnil s kraja zločina.
Predsednik ruske dume Genadij Seleznjov je zločin že opisal kot "politično motiviran umor". Pravi motiv umora je policiji uradno še neznan.
Že pred letom so sicer v nekem moskovskem parku neznanci ustrelili tudi ruskega poslanca Vladimirja Golovljeva, ki je skupaj z Jušenkovom vodil stranko Liberalna Rusija. Jušenkov, ki je bil med letoma 1993 in 1994 ruski minister za informiranje, nato pa vsa leta poslanec v ruski dumi, je že osmi ubiti ruski poslanec od leta 1994.