Prvi dan zasedanja bo namenjen splošni izmenjavi ocen političnega in gospodarskega položaja s poudarkom na pomenu močnih regij v okviru evropskega združevanja. Drugi in tretji dan pa bo v okviru petih delovnih skupin in plenarne seje potekala izmenjava konkretnih predlogov in pobud za izvedbo tekočih in tudi novih projektov; ob koncu naj bi oblikovali skupni protokol, ki bo vključeval pregled dosedanjega in napoved prihodnjega delovanja mešane slovensko-bavarske komisije.
Na tokratnem zasedanju se bodo med drugim posvetili tudi pripravam na slovensko vključevanje v EU, kamor sodijo izobraževanje za posamezna področja državne uprave in drugih sektorjev, strokovni študijski obiski, priprava zakonodaje in njeno uvajanje, izvedbeni predpisi ter predstavitev bavarskih izkušenj pri zaščitnih modelih.