V Sloveniji velja prepoved uvoza živih govedi in izdelkov njihovega izvora za vse države, kjer se je bolezen pojavila pri doma rojenih živalih. Tako je že od leta 1996 prepovedan uvoz iz Velike Britanije, Irske, Portugalske, Francije in Švice, od leta 1998 iz Belgije in Nizozemske, od 2. decembra 2000 pa tudi iz Danske, Španije in Nemčije. Od jutri bo prepovedano uvažati govedo in goveje izdelke še iz Italije.
Klavnice morajo tkiva zbirati ločeno v zabojnike in jih oddati ljubljanskemu Kotu, ki je pristojen za njihovo toplotno obdelavo v kostno-mesno moko in živalske maščobe. Ker uporaba mesno-kostne moke velja za glavnega krivca za razvoj smrtonosne spongiformne encefalopatije govedi (BSE), namerava vlada v marcu prek javnega razpisa izbrati koncesionarja za sežig te moke. Za odstranjevanje živalskih maščob pa je vlada 18. januarja pooblastila ptujsko podjetje Eko-les.
