Real je v Atene odpotoval povsem neobremenjen, saj je bilo že nekaj časa jasno, da se
bo uvrstil med najboljših osem evropskih moštev. Trener Vicente del Bosque se je odločil, da bo spočil nekatere ključne igralce (Zidane, Carlos, Raul, Salgado, Figo, Pavon), kar je opogumilo domače nogometaše, ki so za napredovanje potrebovali točko. Panathinaikos je prek Liberopoulosa prišel v vodstvo v osmi minuti, toda veselje 16.000 domačih navijačev je bilo kratko, le dve minuti pozneje je namreč Morientes izenačil. V prvem polčasu so imeli gostitelji še dve lepi priložnosti, toda vratar Casillas se ni pustil premagati. Tudi v nadaljevanju so bili Grki nevarnejši, v 64. minuti so spet prišli v vodstvo, ko je po prostem strelu Vlaoviča z glavo zatresel mrežo Goumas. Samo minuto pozneje so imeli domači "match žogo", toda Casillas je spektakularno ubranil strel Michelsena. Ko je že izgledalo, da bo Real doživel poraz, je za izenačenje s pravim evrogolom poskrbel Portillo, ki je pol ure pred koncem zamenjal Morientesa. S točko so bili na koncu zadovoljni oboji.
Izid v Atenah je pomenil, da Pavlinov Porto ni imel nobenih možnosti za napredovanje. Pavlin - v Pragi ni stopil na igrišče - in soigralci so potrebovali zmago Reala ter popoln izkupiček v Pragi, a zgodilo se ni ne eno ne drugo. Portugalci so proti Sparti izgubili z 0:2, svoje možnosti so zapravili že v prvem polčasu, ko so zamudili nekaj lepih priložnosti. Tudi Čehi v prvem delu niso bili nenavarni, kar pa so zgrešili v prvih 45 minutah, so nadoknadili v nadaljevanju, v katerem sta se med strelce vpisala Sionko in Jarošik. Gostitelji so si tako z zmago zagotovili tretje mesto, Porto pa je bil v skupini zadnji.
V skupini D je bilo jasno, da se bo v četrtfinale uvrstil Deportivo, za drugo mesto v nadaljevanju pa sta se borila Bayer in Arsenal. Pred zadnjim krogom sta bila moštvi točkovno poravnani, Nemce je čakalo gostovanje v La Coruni, Angleže pa v Torinu. Oboji so bili proti oslabljenima tekmecema, ki nista imela pravega motiva, boljši nasprotnik, toda "lekarnarji" so svojo priložnosti izkoristili, Arsenal pa proti drugemu moštvu Juventusa ni zadel niti iz najbolj ugodnega položaja. Tragični junak je bil Francoz Henry, ki bi se med strelce lahko vpisal že v prvem polčasu, še več priložnosti pa je imel v drugem delu, ko je celo zastreljal enajstmetrovko. Kazen za zgrešene priložnosti Henryja, Ljunberga in Piresa je prišla v 76. minuti, ko je bil z glavo natančen Urugvajec Zalayeta.
V La Coruni so si gosti odločilno prednost priigrali z odlično igro po bokih. S strani so pošiljali nevarne žoge pred vrata Deportiva, taka igra pa jim je zagotovila tri zadetke. Strelci so bili Ballack, Schneider in Neuville, medtem ko je častni zadetek za domače dosegel Tristan, ki je v igro vstopil v drugem delu.