Prosinečki je že dejal, da je to njegova zadnja poklicna pogodba v karieri in da bo po koncu sezone 2003/04 prenehal z aktivno igralsko kariero.
V dolgoletni in zelo uspešni karieri je Prosinečki branil barve hrvaškega Dinama, srbske Crvene zvezde, španskega Reala iz Madrida, Barcelone, Ovieda in Seville, angleškega Portsmoutha, belgijskega Standarda in ljubljanske Olimpije.