Njegov čas pa je zadostoval, da je v skupnem seštevku prehitel vodilnega po dveh etapah Marka Žepiča iz kranjske Save. Drugo mesto je v kronometru zasedel predlanski svetovni prvak, Jevgenij Petrov, tretje pa Novomeščan Jure Zrimšek.
* Izidi 3. etape, 13 kilometrov dolgega kronometra:
1. Sean Podgornik (Slo/HiT Casino) 16:10
2. Jevgenij Petrov (Rus) + 0:14
3. Jure Zrimšek (Slo Krka Telekom) + 0:26
4. Patrik Sinkewitz (Nem) 0:26
5. Bernhard Eisel (Avt) 0:33
6. Martin Čotar (Hrv/Sava) 0:35
7. Filippo Pozzato (Ita) 0:35
8. Gregor Gazvoda (Perutnina Ptuj) 0:39
9. Valter Bonča (Slo/PP&KK) 0:41
10. Sebastian Siedler (Nem) 0:50
* skupni vrstni red:
1. Dean Podgornik (Slo/HiT Casino) 7:46:40
2. Marko Žepič (Slo/Sava Kranj) + 0:15
3. Jevgenij Petrov (Rus) 0:23
4. Lars Wackernagel (Nem) 0:25
5. Jure Zrimšek (Slo/Krka Telekom) 0:33
6. Patrik Sinkewitz (Nem) 0:35
7. Bernhard Eisel (Avt) 0:42
8. Martin Čotar (Hrv/Sava Kranj) 0:44
9. Filippo Pozzato (Ita) 0:44
10. Gregor Gazvoda (Slo/Perutnina Ptuj) 0:48