Večino nalog te organizacije namreč v skladu z načrti na področju obrambe in varnosti postopno prevzema Evropska unija. Ko bo unija sposobna opravljati zadevne funkcije, bodo posamezna telesa WEU razpuščena. Za ciljni datum začetka delovanja "evropske obrambne unije", ko bo ministrski svet po potrebi lahko razpravljal tudi o problematiki z vojaško vsebino, je postavljen konec tega leta. Kot je napovedalo francosko predsedstvo Evropske unije, bo tako WEU po decembrskem vrhu v Nici - datum sicer še ni določen - dokončno izgubila svojo glavno funkcijo kot vojaška komponenta EU, to vlogo pa bo prevzela EU. S tem bo EU dobila "oboroženo roko" in postala vojaška sila.
Čeprav WEU kmalu ne bo več imela vloge, ki bi ji omogočala upravljanje s krizami, pa ne bo izginila. Med drugim bo še vedno forum za razprave o varnosti in obrambi za evropske parlamentarce
